Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Mrpl28Q9D1B9 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Mrpl28Q9D1B9 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Mrpl28Q9D1B9 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
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