Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Gm19445-201ENSMUST00000193649 2438 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Apobec4-201ENSMUST00000068875 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Gm43288-201ENSMUST00000197594 2628 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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