Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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SdhdQ9CXV1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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SdhdQ9CXV1 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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SdhdQ9CXV1 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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SdhdQ9CXV1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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SdhdQ9CXV1 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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SdhdQ9CXV1 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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