Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Atxn3Q9CVD2 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Atxn3Q9CVD2 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Atxn3Q9CVD2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Atxn3Q9CVD2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Atxn3Q9CVD2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Atxn3Q9CVD2 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Atxn3Q9CVD2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Atxn3Q9CVD2 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn3Q9CVD2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Atxn3Q9CVD2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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