Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmed6Q9CQG0 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms