Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms