Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Rab5aQ9CQD1 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Rab5aQ9CQD1 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Rab5aQ9CQD1 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Rab5aQ9CQD1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Rab5aQ9CQD1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
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