Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms