Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms