Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms