Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab28Q99KL7 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab28Q99KL7 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab28Q99KL7 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab28Q99KL7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab28Q99KL7 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab28Q99KL7 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rab28Q99KL7 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rab28Q99KL7 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab28Q99KL7 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab28Q99KL7 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rab28Q99KL7 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rab28Q99KL7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab28Q99KL7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rab28Q99KL7 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Rab28Q99KL7 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab28Q99KL7 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab28Q99KL7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab28Q99KL7 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab28Q99KL7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab28Q99KL7 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab28Q99KL7 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab28Q99KL7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab28Q99KL7 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab28Q99KL7 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab28Q99KL7 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab28Q99KL7 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab28Q99KL7 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab28Q99KL7 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab28Q99KL7 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab28Q99KL7 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab28Q99KL7 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab28Q99KL7 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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