Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg5Q99J83 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms