Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms