Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms