Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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