Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ccdc115Q8VE99 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ccdc115Q8VE99 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ccdc115Q8VE99 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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