Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hecw1Q8K4P8 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms