Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X2

Rbm48, RNA-binding protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm48Q8K2X2 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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