Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
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Pkn3Q8K045 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Pkn3Q8K045 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pkn3Q8K045 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pkn3Q8K045 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pkn3Q8K045 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pkn3Q8K045 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms