Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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LgsnQ8CIX8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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LgsnQ8CIX8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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LgsnQ8CIX8 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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LgsnQ8CIX8 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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LgsnQ8CIX8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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