Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms