Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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