Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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4933409G03RikQ8C5U0 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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4933409G03RikQ8C5U0 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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4933409G03RikQ8C5U0 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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4933409G03RikQ8C5U0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
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4933409G03RikQ8C5U0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
4933409G03RikQ8C5U0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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4933409G03RikQ8C5U0 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
4933409G03RikQ8C5U0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
4933409G03RikQ8C5U0 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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4933409G03RikQ8C5U0 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
4933409G03RikQ8C5U0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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4933409G03RikQ8C5U0 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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4933409G03RikQ8C5U0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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4933409G03RikQ8C5U0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
4933409G03RikQ8C5U0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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4933409G03RikQ8C5U0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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4933409G03RikQ8C5U0 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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4933409G03RikQ8C5U0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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4933409G03RikQ8C5U0 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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