Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1N8

Defa22, Alpha-defensin 22, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa22Q8C1N8 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa22Q8C1N8 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms