Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Ttc21aQ8C0S4 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Ttc21aQ8C0S4 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Ttc21aQ8C0S4 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Ttc21aQ8C0S4 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Ttc21aQ8C0S4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Ttc21aQ8C0S4 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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