Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXT9

Sec22c, Vesicle-trafficking protein SEC22c, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22cQ8BXT9 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sec22cQ8BXT9 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sec22cQ8BXT9 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sec22cQ8BXT9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sec22cQ8BXT9 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sec22cQ8BXT9 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sec22cQ8BXT9 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sec22cQ8BXT9 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sec22cQ8BXT9 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sec22cQ8BXT9 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sec22cQ8BXT9 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec22cQ8BXT9 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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