Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ube3dQ8BX13 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ube3dQ8BX13 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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