Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms