Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxo38Q8BMI0 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms