Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Smarcal1Q8BJL0 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Smarcal1Q8BJL0 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Smarcal1Q8BJL0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Smarcal1Q8BJL0 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Smarcal1Q8BJL0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Smarcal1Q8BJL0 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Smarcal1Q8BJL0 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Smarcal1Q8BJL0 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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