Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htatsf1Q8BGC0 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms