Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW6

H2-M10.3, Histocompatibility 2, M region locus 10.3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.3Q85ZW6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.3Q85ZW6 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.3Q85ZW6 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.3Q85ZW6 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.3Q85ZW6 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.3Q85ZW6 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.3Q85ZW6 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.3Q85ZW6 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.3Q85ZW6 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.3Q85ZW6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
H2-M10.3Q85ZW6 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms