Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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