Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp8b3Q6UQ17 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms