Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Snx13Q6PHS6 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Snx13Q6PHS6 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Snx13Q6PHS6 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Snx13Q6PHS6 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Snx13Q6PHS6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Snx13Q6PHS6 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Snx13Q6PHS6 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Snx13Q6PHS6 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx13Q6PHS6 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx13Q6PHS6 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx13Q6PHS6 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx13Q6PHS6 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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