Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM2

Srsf1, Serine/arginine-rich splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf1Q6PDM2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf1Q6PDM2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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