Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt39Q6IFX4 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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