Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx11Q6AXC6 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx11Q6AXC6 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx11Q6AXC6 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ddx11Q6AXC6 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ddx11Q6AXC6 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ddx11Q6AXC6 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ddx11Q6AXC6 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx11Q6AXC6 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ddx11Q6AXC6 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx11Q6AXC6 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx11Q6AXC6 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx11Q6AXC6 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx11Q6AXC6 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx11Q6AXC6 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ddx11Q6AXC6 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms