Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ric1Q69ZJ7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ric1Q69ZJ7 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ric1Q69ZJ7 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ric1Q69ZJ7 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ric1Q69ZJ7 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ric1Q69ZJ7 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ric1Q69ZJ7 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ric1Q69ZJ7 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ric1Q69ZJ7 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ric1Q69ZJ7 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ric1Q69ZJ7 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ric1Q69ZJ7 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ric1Q69ZJ7 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ric1Q69ZJ7 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ric1Q69ZJ7 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ric1Q69ZJ7 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ric1Q69ZJ7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ric1Q69ZJ7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ric1Q69ZJ7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms