Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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