Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms