Protein–RNA interactions for Protein: Q61191

Hcfc1, Host cell factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,045 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1Q61191 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Hcfc1Q61191 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
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Hcfc1Q61191 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hcfc1Q61191 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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