Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfrsf8Q60846 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms