Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn2cQ60772 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms