Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Samhd1Q60710 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms