Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
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Tns3Q5SSZ5 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Tns3Q5SSZ5 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Tns3Q5SSZ5 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
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Tns3Q5SSZ5 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tns3Q5SSZ5 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms