Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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