Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dnah12Q3V0Q1 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms