Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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BC051142Q3V0M8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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BC051142Q3V0M8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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BC051142Q3V0M8 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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BC051142Q3V0M8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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BC051142Q3V0M8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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BC051142Q3V0M8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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BC051142Q3V0M8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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BC051142Q3V0M8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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BC051142Q3V0M8 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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