Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Lrrc43Q3V0L5 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Lrrc43Q3V0L5 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Lrrc43Q3V0L5 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Lrrc43Q3V0L5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Lrrc43Q3V0L5 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Lrrc43Q3V0L5 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Lrrc43Q3V0L5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Lrrc43Q3V0L5 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms